数据集概述
本数据集记录了铁线蕨属(Adiantum)三种植物(A. aleuticum、A. shastense、A. capillus-veneris)的质体RNA编辑位点信息。通过比较三种植物的编辑位点数量、位置及类型差异,揭示铁线蕨属内RNA编辑频率的快速进化特征,为蕨类植物质体基因组研究提供基础数据。
文件详解
- Adiantum_aleuticum_sitebysite_table.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录A. aleuticum的质体RNA编辑位点信息,包含505个编辑位点的位置、类型等数据
- Adiantum_shastense_sitebysite_table.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录A. shastense的质体RNA编辑位点信息,包含509个编辑位点的位置、类型等数据
- Adaintumcapillusveneris_sitebysite_table.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录A. capillus-veneris的质体RNA编辑位点信息,包含350个编辑位点的位置、类型等数据
数据来源
论文“Variation in frequency of plastid RNA editing within Adiantum (Pteridaceae) implies rapid evolution in fern plastomes”
适用场景
- 蕨类植物分子进化研究:分析铁线蕨属内RNA编辑位点的变异规律,探究质体基因组的快速进化特征
- 植物RNA编辑机制研究:比较不同类型(C-to-U、U-to-C)编辑位点的保守性差异,解析RNA编辑的分子机制
- 植物基因组功能注释:通过编辑位点数据完善铁线蕨属质体基因的功能注释,特别是起始/终止密码子相关的编辑位点
- 植物系统发育分析:利用RNA编辑位点的变异信息,辅助铁线蕨属及相关蕨类植物的系统发育关系构建