数据集概述
本数据集为“选择对抗种间交配的快速进化及其基因组后果”研究的配套数据,聚焦埃及伊蚊(Aedes aegypti)对亚洲虎蚊种间交配的抗性进化。包含实验室选育与野生种群的基因组分析结果,涉及连锁不平衡P值、SNP位点、序列文件等8个数据文件,支持研究种间交配行为相关的基因组区域及候选基因。
文件详解
- 文件名称:P-val-for-LD_49LociRevisedRevised.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:49个位点连锁不平衡(LD)分析的P值数据
- 文件名称:SelectedvsWild-expermt.map、SelectedvsWild-expermt.ped
- 文件格式:MAP、PED
- 字段映射介绍:实验室选育种群与野生种群对比实验的基因图谱(.map)与基因型数据(.ped)
- 文件名称:31OutlierSequences.bed
- 文件格式:BED
- 字段映射介绍:31个离群序列的基因组位置信息
- 文件名称:FloridaPop.ped、FloridaPop.map
- 文件格式:PED、MAP
- 字段映射介绍:佛罗里达野生种群的基因型数据(.ped)与基因图谱(.map)
- 文件名称:YvsNOutlierLoci.bed
- 文件格式:BED
- 字段映射介绍:交配成功与未成功组间离群位点的基因组位置信息
- 文件名称:42seqsOf49SNPs_ForMappingToGenome.fas
- 文件格式:FAS
- 字段映射介绍:49个SNP位点中42个的序列数据,用于基因组比对
数据来源
论文“Rapid evolution and the genomic consequences of selection against interspecific mating”
适用场景
- 基因组进化研究:分析埃及伊蚊对抗种间交配选择的基因组响应及快速进化机制
- 种间交配行为机制研究:通过离群位点与候选基因探索种间交配选择的分子基础
- 入侵物种互作分析:揭示入侵物种(亚洲虎蚊)对本地物种(埃及伊蚊)的选择压力及进化影响
- 抗性基因挖掘:识别与种间交配抗性相关的基因组区域及功能基因
- 种群遗传学分析:对比实验室选育与野生种群的遗传差异及选择信号