数据集概述
本数据集展示了针对70Gb以上超大基因组的AFLP实验优化方案，使用识别8碱基序列的限制性内切酶（AscI和SbfI），通过+3选择性碱基引物减少扩增片段数量，同时分析片段数量与基因组大小对同源片段（大小同塑性）的影响，以及不同反应条件对槲寄生等超大基因组物种实验重复性和条带强度的作用。
文件详解
- 文件名称：README_for_AFLP-samples.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：AFLP实验样本相关说明文档，可能包含样本信息、实验流程或结果解释等内容
- 文件名称：AFLP-samples.rar
- 文件格式：RAR
- 字段映射介绍：AFLP实验样本数据压缩包，包含实验原始数据或处理后的样本信息
- 文件名称：AFLP_in_silico_size_homoplasy.R
- 文件格式：R
- 字段映射介绍：用于分析AFLP实验中基因组大小同塑性的R语言脚本，包含数据处理和分析代码
数据来源
论文“Optimisation of AFLP for extremely large genomes over 70 Gb”
适用场景
- 基因组学实验方法优化：研究针对超大基因组的AFLP实验条件优化策略
- 分子标记技术研究：分析限制性内切酶选择、引物设计对AFLP实验结果的影响
- 生物信息学数据分析：利用R脚本进行基因组大小同塑性的模拟与验证
- 植物基因组多样性研究：检测大基因组物种（如槲寄生、雪花莲、矮松）的种内遗传变异
