阿拉斯加基奈地区黑鱂鱼肠道内容物宏基因组原始数据集2019

数据集概述

本数据集包含2019年采自美国阿拉斯加基奈地区的五条黑鱂鱼肠道内容物的宏基因组原始数据，以及标本信息、DNA提取与测序方法、分析文档等相关文件，为研究该鱼类肠道微生物多样性提供基础数据。

文件详解

• 原始测序数据文件（共10个.gz格式文件）：如6382-2020-01-30-MLB01-mlCOIint-jgHCO2198_R2.fastq.gz，为Illumina MiSeq测序产生的双端原始序列文件
• 方法文档：
• Illumina MiSeq Two-Step Method 454 profile Takara.docx：测序方法说明文档
• Data_Analysis_Methodology.pdf：数据分析方法文档
• Bower 6382.pdf：可能为项目相关报告
• 引物与样本信息文件：
• Bowser_6382M.mlCOIint-jgHCO2198.oligos：使用的mlCOIint/jgHCO2198引物序列文件
• Bowser_6382M.txt：样本信息文件
• 标本数据文件：ArctosData_635EEC90E9.csv：从Arctos平台下载的标本数据文件

数据来源

• Arctos平台（http://arctos.database.museum/project/10003367）
• RTL Genomics（https://rtlgenomics.com/）

适用场景

• 鱼类肠道微生物多样性研究：分析黑鱂鱼肠道菌群组成与结构
• 环境微生物学研究：探究阿拉斯加地区淡水鱼类肠道微生物与环境的关联
• 分子生态学研究：基于宏基因组数据开展物种鉴定与群落分析
• 测序方法学参考：为类似微生物多样性检测实验提供方法学依据