数据集概述
本数据集聚焦于Alewife（Alosa pseudoharengus）适应淡水的转录组机制，通过比较溯河性祖先种群与独立演化的陆封种群在淡水（0 ppt）和盐水（35 ppt）环境下的转录响应，揭示渗透压调节基因表达的平行进化特征，为理解生物生态位适应的功能基因组机制提供数据支持。
文件详解
- 文件名称：CombinedAnnotation_alewife_nr.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含Alewife转录组数据的基因注释信息，可能涉及渗透压调节相关基因（如Na+/K+-ATPase α亚基的淡水/盐水同源基因）的表达量数据、基因功能注释及种群间表达差异分析结果等核心内容。
数据来源
论文“Transcriptomic imprints of adaptation to fresh water: parallel evolution of osmoregulatory gene expression in the Alewife”
适用场景
- 进化基因组学研究：分析陆封种群与溯河性祖先在转录组水平的分化模式，探究淡水适应的平行进化机制。
- 渗透压调节基因功能分析：研究离子转运相关基因（如Na+/K+-ATPase）的表达变化与盐度耐受能力的关联。
- 生态适应转录组机制研究：揭示生物应对环境盐度变化的转录响应策略，为物种生态位扩张的分子机制提供参考。
- 比较生理学基因组学分析：通过比较不同种群的转录组数据，理解基因表达在生态适应中的功能重要性。
