Allen_Based_小鼠脑CCF_v3_1_ASR标准定位标签数据

数据集概述

本数据集为基于Allen小鼠脑通用坐标框架v3.1的3D多通道图像,采用ASR定位规范,匹配BrainGlobe atlases。包含NISSL、标签边界、ARA及模65000标签等4个通道,voxel尺寸10微米,通过模运算适配16位图像格式且无信息损失,附相关本体文件。

文件详解

  • 文件名称:mouse_brain_ccfv3p1asr.xml
  • 文件格式:XML(适配ImageJ/Fiji的BigDataViewer格式)
  • 字段映射介绍:3D多通道图像,各通道内容为:
  • 通道0:NISSL图像数据
  • 通道1:LABELS Border(标签边界)
  • 通道2:ARA(Allen Reference Atlas)
  • 通道3:LABELS Mod 65000(标签值模65000处理结果)
  • 关联文件:包含allen brain相关本体文件1.json

数据来源

Allen Institute,基于Allen Mouse CCF v3原始数据,需引用论文《The Allen Mouse Brain Common Coordinate Framework: A 3D Reference Atlas》(DOI:10.1016/j.cell.2020.04.007)

适用场景

  • 神经科学脑结构定位:用于小鼠脑区的精确3D空间定位与可视化
  • 脑图谱数据整合:匹配BrainGlobe atlases,支持多平台脑图谱数据交叉分析
  • 脑科学图像处理:验证16位图像格式下高值标签的模运算兼容方案
  • 神经解剖学研究:结合NISSL与标签通道,分析脑区边界与结构对应关系
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.0 MiB
最后更新 2026年1月23日
创建于 2026年1月23日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。