数据集概述
本数据集记录了通过改变转录因子(TF)结合特性,研究基础基因转录动力学的实验数据。包含单分子成像、RNA-FISH等技术获取的转录爆发频率、持续时间、大小等参数,以及转录因子搜索时间、结合到转录起始延迟等量化结果,为基因调控机制研究提供基础数据。
文件详解
- MS2_burst_durations.xlsx(XLSX格式):记录MS2标记的转录爆发持续时间数据
- FISH.xlsx(XLSX格式):单分子RNA-FISH实验获取的转录相关数据
- data.mat(MAT格式):包含实验原始数据或处理后的综合数据
- tracks_sm_tracking.xlsx(XLSX格式):单分子追踪实验产生的转录因子或RNA轨迹数据
- TALE-TF_degradation_with_AID.xlsx(XLSX格式):TALE转录因子结合AID系统的降解实验数据
数据来源
论文“Altering transcription factor binding reveals comprehensive transcriptional kinetics of a basic gene”
适用场景
- 基因转录调控机制研究:分析转录因子结合对转录爆发频率、持续时间和大小的影响
- 分子动力学建模:基于转录爆发参数构建基因表达调控的定量模型
- 转录因子功能分析:研究转录因子停留时间、浓度变化对基因活性的调控作用
- 基因表达动力学研究:解析转录起始延迟、转录爆发等关键动力学过程的分子机制