数据集概述
本数据集围绕Amaranthus palmeri（帕尔默苋）的EPSPS基因拷贝数变异与草甘膦抗性的关系展开，包含22个种群的数字 droplet PCR拷贝数数据、表型抗性数据及实验设计信息，用于量化基因拷贝数与抗性表型的关联，探究抗性阈值及种群内变异规律。
文件详解
- 文档文件
- 文件名称：ReadMe.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：数据集说明文档，包含实验背景、数据采集方法、文件说明等内容
- 数据文件
- 文件名称：Master_Planting_List2_Feb16.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含Pot、Block_Pot、Position、Greenhouse、Bench、Tray、Place、Population、State、Family、Planting.Order、Plant、Treatment、Location等实验种植信息字段
- 文件名称：R_Mapping_Locations.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含Population、State、Latitude、Longitude等种群地理坐标信息字段
- 文件名称：Block1_Resistance_F_Fitness.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：Block1区块的抗性与适合度数据
- 文件名称：ddPCR_data_Feb16.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：2016年2月采集的数字 droplet PCR（ddPCR）EPSPS基因拷贝数数据
- 文件名称：ddPCR_replicates.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：ddPCR实验的重复样本数据
- 文件名称：Experiment1_GH_2017_Block1_2_Resistance_sby.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：2017年温室实验Block1和Block2的草甘膦抗性数据
适用场景
- 农业杂草抗性机制研究: 分析EPSPS基因拷贝数变异对草甘膦抗性的影响，探究抗性阈值规律
- 杂草种群遗传学分析: 基于种群地理坐标与抗性数据，研究Amaranthus palmeri抗性种群的地理分布特征
- 抗性进化动态研究: 利用种群内抗性变异数据，模拟杂草抗性进化的历史与未来趋势
- 农业化学防治策略优化: 基于基因拷贝数与抗性的关联，为草甘膦使用及抗性治理提供数据支持
- 分子生物学实验设计参考: 参考ddPCR实验设计与数据格式，开展类似基因拷贝数变异研究
