数据集概述
本数据集是论文《Is additive coding useful for morphological phylogenetic analyses? An empirical evaluation》的补充文件，包含形态矩阵、分子矩阵、系统发育树、系统发育信号分析及基因采样信息等13个文件，用于评估附加编码在形态系统发育分析中的实用性。
文件详解
- 形态矩阵文件（.ss格式，共4个）
- 文件名称：Morph matrix 1_quantitative chars with 6 states.ss、Morph matrix 2_quantitative chars decomposed into binary characters.ss、Morph matrix 3_quantitative chars best binary opt.ss、Morph matrix 4_quantitative chars 2best binary opt.ss
- 字段映射：包含定量性状的形态学数据矩阵，涵盖6状态原始定量性状、分解为二进制性状的定量性状及最优二进制优化后的定量性状等形态学特征信息
- 分子矩阵文件（.nex格式，共3个）
- 文件名称：Molecular matrix.nex、SSMolecMorph2PartCharsAdditiv.nex、SSMolecMorph2PartCharsNonAdditiv.nex
- 字段映射：包含物种分子数据矩阵，以及分子与形态数据结合的附加编码、非附加编码分区字符矩阵
- 系统发育树文件（.tif格式2个、.tre格式2个）
- 文件名称：Tree A_All data.tif、Tree B_Molecular data.tif、Tree A obtained with all data analyzed.tre、Tree B obtained with only molecular data.tre
- 字段映射：展示全数据（形态+分子）分析得到的系统发育树、仅分子数据分析得到的系统发育树的图像及树形文件
- 辅助分析文件（.xlsx格式，共2个）
- 文件名称：Phylogenetic signal Blomberg K.xlsx、Molecular data_genes sampled per species.xlsx
- 字段映射：包含Blomberg K系统发育信号分析数据、各物种采样基因信息数据
数据来源
Ament & Almeida（submitted）论文《Is additive coding useful for morphological phylogenetic analyses? An empirical evaluation》
适用场景
- 形态系统发育分析方法评估: 用于验证附加编码在形态学数据系统发育分析中的有效性与准确性
- 分子与形态数据整合研究: 分析分子数据与形态数据结合对系统发育树构建的影响
- 系统发育信号分析: 基于Blomberg K值探究形态性状的系统发育信号强度
- 物种基因采样策略研究: 分析不同物种的基因采样数量对系统发育分析结果的影响
