数据集概述
本数据集为男性不育症相关研究的配套代码与数据，包含外周血CD3+ T细胞的单细胞RNA测序分析结果，涉及少弱畸精子症（OAT）、特发性非梗阻性无精子症（NOA）患者及健康对照组（FER），可用于研究T细胞耗竭或衰老特征与男性不育症类型的相关性。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称：README.md
- 文件格式：MD
- 字段映射介绍：项目说明文档，包含研究背景、样本信息及分析流程概述
- 数据类文件
- 文件名称：SingleCell_seurat_metadata.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：单细胞测序Seurat分析元数据文件，包含样本的基础信息与实验参数
- 文件名称：samplesheet.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：样本信息表，包含Lane（测序 lane）、Sample（样本编号）、Index（索引序列）、Group（分组：FER/OAT/NOA）等字段
- 文件名称：gsea_intracluster_OAT_NOA_vs_FER.rds
- 文件格式：RDS
- 字段映射介绍：基因集富集分析（GSEA）结果文件，存储OAT、NOA组与FER组的簇内富集分析数据
- 代码类文件
- 文件名称：Figure_5c_6a_6d.R
- 文件格式：R
- 字段映射介绍：用于生成论文中Figure 5c、6a、6d图表的R代码
- 文件名称：Figure_5b.R
- 文件格式：R
- 字段映射介绍：用于生成论文中Figure 5b图表的R代码
- 文件名称：1_PreProcessing_Data.R
- 文件格式：R
- 字段映射介绍：数据预处理流程的R代码，包含原始数据清洗与标准化步骤
数据来源
论文"Specific types of male infertility are correlated with T cell exhaustion or senescence signatures"
适用场景
- 男性不育症免疫机制研究: 分析T细胞耗竭/衰老特征与OAT、NOA等不育症类型的关联机制
- 单细胞转录组数据分析: 基于Seurat元数据与预处理代码，复现或拓展男性不育症患者T细胞的单细胞测序分析
- 基因集富集分析应用: 利用GSEA结果文件研究不育症相关T细胞亚群的功能通路变化
- 医学图表复现与验证: 通过R代码复现论文中的关键实验图表，验证研究结果的可靠性
- 生殖免疫标志物筛选: 基于T细胞转录组数据挖掘男性不育症诊断或预后相关的免疫标志物
