数据集概述
本数据集围绕一年生豆科植物Amphicarpaea bracteata的隐存同域类群分化与隔离展开,包含128个个体的SNP变异数据、76个个体的基因型与叶片形态数据,以及叶片图像和实验数据文件,用于分析该自交物种的遗传分化、表型关联及生殖隔离机制。
文件详解
- README_for_leaf_images.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:叶图像压缩包的说明文档,描述leaf_images.zip包含的三个目录内容,涉及叶片表型分析的图像类型、拍摄工具及尺度信息
- leaf_images.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含三个目录,分别为hairs_with_scale(手持数码显微镜拍摄的小叶背面带尺度图像)、terminal_leaflet(300dpi的顶生小叶二值图像)、lateral_leaflet(300dpi的侧生小叶二值图像)
- ambr_HRM_tm.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含Amphicarpaea bracteata的HRM(高分辨率熔解曲线)实验相关的Tm(解链温度)数据,用于基因型分析
数据来源
论文“Divergence and isolation of cryptic sympatric taxa within the annual legume Amphicarpaea bracteata”
适用场景
- 植物遗传学研究:分析Amphicarpaea bracteata的SNP变异、遗传分化及种群结构
- 表型-基因型关联分析:通过叶片图像与遗传数据连接表型变异和遗传变异
- 生殖隔离机制研究:评估类群间迁移率、杂交频率及基因流限制因素
- 植物分类学修订:基于遗传与表型数据重新界定该物种的分类单元
- 共生微生物互作分析:探究病原菌或根瘤菌对不同基因型类群的特异性影响