AMRProfiler抗菌耐药基因与突变识别工具数据集

数据集概述

本数据集包含AMRProfiler工具的源代码及配套数据库，该工具可识别近18000种细菌的获得性耐药基因、耐药相关点突变及rRNA基因突变，整合CARD、ResFinder等数据库数据，支持多格式基因组分析。

文件详解

• amrprofiler-main.zip：工具源代码压缩包，为GitHub仓库文件，需配合其他数据库文件夹本地运行
• databases.zip：AMRProfiler运行所需数据库压缩包，包含非冗余耐药基因条目等数据
• db.zip：AMRProfiler运行所需数据库压缩包，提供耐药相关基因及突变记录
• refseq.zip：AMRProfiler运行所需数据库压缩包，含rRNA基因拷贝数及突变目录等数据

适用场景

• 细菌耐药机制研究：分析不同细菌的耐药基因与突变特征
• 临床耐药检测：辅助临床样本中抗菌药物耐药标志物的快速识别
• 公共卫生监测：支持大规模细菌耐药基因谱的筛查与分析
• 耐药数据库整合研究：验证多源耐药数据的整合与标准化方法