Anna_s_hummingbird_Based_肠道微生物组组成与宿主因素关联分析数据

数据集概述

本数据集针对安娜蜂鸟(Calypte anna)的肠道微生物组进行分析,通过16S rRNA基因扩增子测序,探究其粪便与肠道不同部位微生物组的差异,以及性别、年龄、痘病毒感染状态等宿主因素对微生物组成的影响,包含4个相关文件。

文件详解

  • Readme.docx
  • 文件格式:DOCX
  • 字段映射介绍:数据集说明文档,包含研究背景、实验方法、数据处理流程等信息
  • seqtab.nochim.rds
  • 文件格式:RDS
  • 字段映射介绍:去噪后的扩增子序列变体(ASV)表格,记录各样本中ASV的丰度信息
  • taxa_reorder.csv
  • 文件格式:CSV
  • 字段映射介绍:包含微生物分类信息,字段有Kingdom(界)、Phylum(门)、Class(纲)、Order(目)、Family(科)、Genus(属)、ASV(扩增子序列变体编号)、Sequence(序列)
  • HummingbirdSamps.csv
  • 文件格式:CSV
  • 字段映射介绍:样本元数据表格,字段有Date(采样日期)、Site(采样地点)、SampleNo(样本编号)、SampleName(样本名称)、Species(物种)、Age(年龄)、Sex(性别)、SampleType(样本类型)、DNA: ng/mL(DNA浓度)、A260/A280(核酸纯度)、Mites(螨虫感染情况)、Pox(痘病毒感染情况)、Wing(翅长)、Beak(喙长)、Weight(体重)、Molt(换羽情况)、Fat(脂肪量)、Notes(备注)

适用场景

  • 野生动物肠道微生物组结构研究: 分析安娜蜂鸟肠道不同部位与粪便微生物组的组成差异
  • 宿主因素对微生物组的影响分析: 探究性别、年龄、痘病毒感染等因素与微生物组成的关联
  • 微生物分类学研究: 通过taxa_reorder.csv中的分类信息,解析蜂鸟肠道微生物的分类组成
  • 野生动物生理学与健康评估: 利用微生物组数据关联宿主生理指标,评估蜂鸟健康状态
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 1.71 MiB
最后更新 2026年1月13日
创建于 2026年1月13日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。