数据集概述
本数据集基于转录组数据构建环节动物门系统发育树,涵盖68750-170497个氨基酸位点、305-622种蛋白质,解析环节动物基部类群(如龙介科、火刺毛虫科等)关系,明确寄生蠕虫类群演化位置,支持环节动物祖先特征重建及早期分化时间推断,包含19个相关文件。
文件详解
- 转录组数据集文件(Dataset_*.fas)
- 文件名称:如Dataset_77-2.fas、Dataset_72-2.fas等(共7个)
- 文件格式:FAS
- 字段映射介绍:包含转录组数据对应的氨基酸序列信息,用于系统发育分析的核心序列数据源
- 补充分析表格(Supplementary File S*.xlsx)
- 文件名称:如Supplementary File S3_Chaetopteridae within Sedentaria.xlsx等(共9个)
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录不同类群(如Chaetopteridae、Magelonidae等)在系统发育树中位置的补充分析结果,支持类群演化关系验证
- 形态学矩阵文件(Supplementary Files S10-S11.nex)
- 文件名称:Supplementary Files S10_MorphologicalMatrix_Likelihood.nex、Supplementary Files S11_MorphologicalMatrix_Parsimony.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:包含形态学特征矩阵数据,用于似然法和简约法的形态学分析
- 存档文件(lophotrochozoa_hmmer3.tar.gz)
- 文件名称:lophotrochozoa_hmmer3.tar.gz
- 文件格式:GZ
- 字段映射介绍:包含冠轮动物相关的HMMER3分析存档数据,支持跨类群的序列比对与分析
数据来源
论文“Illuminating the base of the annelid tree using transcriptomics”
适用场景
- 环节动物系统发育研究:分析环节动物门内部类群(如基部类群、寄生类群)的演化关系与分类地位
- 动物演化特征重建:基于系统发育树推断环节动物祖先的形态特征(如触须、眼睛、疣足等)
- 早期生命演化时间推断:结合化石记录(如星虫动物门5.2亿年前化石)分析环节动物早期分化时间
- 转录组与形态学数据整合分析:利用序列数据与形态学矩阵开展多证据综合的系统发育研究