Annelida_Transcriptomics_环节动物门系统发育转录组研究数据

数据集概述

本数据集基于转录组数据构建环节动物门系统发育树,涵盖68750-170497个氨基酸位点、305-622种蛋白质,解析环节动物基部类群(如龙介科、火刺毛虫科等)关系,明确寄生蠕虫类群演化位置,支持环节动物祖先特征重建及早期分化时间推断,包含19个相关文件。

文件详解

  • 转录组数据集文件(Dataset_*.fas)
  • 文件名称:如Dataset_77-2.fas、Dataset_72-2.fas等(共7个)
  • 文件格式:FAS
  • 字段映射介绍:包含转录组数据对应的氨基酸序列信息,用于系统发育分析的核心序列数据源
  • 补充分析表格(Supplementary File S*.xlsx)
  • 文件名称:如Supplementary File S3_Chaetopteridae within Sedentaria.xlsx等(共9个)
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:记录不同类群(如Chaetopteridae、Magelonidae等)在系统发育树中位置的补充分析结果,支持类群演化关系验证
  • 形态学矩阵文件(Supplementary Files S10-S11.nex)
  • 文件名称:Supplementary Files S10_MorphologicalMatrix_Likelihood.nex、Supplementary Files S11_MorphologicalMatrix_Parsimony.nex
  • 文件格式:NEX
  • 字段映射介绍:包含形态学特征矩阵数据,用于似然法和简约法的形态学分析
  • 存档文件(lophotrochozoa_hmmer3.tar.gz)
  • 文件名称:lophotrochozoa_hmmer3.tar.gz
  • 文件格式:GZ
  • 字段映射介绍:包含冠轮动物相关的HMMER3分析存档数据,支持跨类群的序列比对与分析

数据来源

论文“Illuminating the base of the annelid tree using transcriptomics”

适用场景

  • 环节动物系统发育研究:分析环节动物门内部类群(如基部类群、寄生类群)的演化关系与分类地位
  • 动物演化特征重建:基于系统发育树推断环节动物祖先的形态特征(如触须、眼睛、疣足等)
  • 早期生命演化时间推断:结合化石记录(如星虫动物门5.2亿年前化石)分析环节动物早期分化时间
  • 转录组与形态学数据整合分析:利用序列数据与形态学矩阵开展多证据综合的系统发育研究
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 192.13 MiB
最后更新 2026年1月18日
创建于 2026年1月18日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。