桉生红基酵母新种描述数据集

数据集概述

该数据集包含用于描述新种桉生红基酵母(Erythrobasidium eucalypti)的分子序列数据及系统发育分析结果,涉及ITS、LSU、SSU基因片段的比对文件与最大似然法(ML)分析生成的系统发育树文件,为该新物种的分类学鉴定提供分子依据。

文件详解

该数据集包含一个目录及8个文件,具体说明如下: - 目录名称: Description of Erythrobasidium eucalypti R Knop., Hammerb., M. Groenew., & T Bose, sp. nov/ - 基因序列比对文件(.nex格式): - Erythrobasidium-ITS-aln.nex: ITS基因片段的比对数据文件 - Erythrobasidium-LSU-aln.nex: LSU基因片段的比对数据文件 - Erythrobasidium-SSU-aln.nex: SSU基因片段的比对数据文件 - Erythrobasidium-concat.nex: ITS、LSU、SSU基因片段的联合比对数据文件 - 系统发育树文件(.tre格式): - Erythrobasidium-ITS-tree.tre: ITS基因片段ML分析生成的系统发育树 - Erythrobasidium-LSU-tree.tre: LSU基因片段ML分析生成的系统发育树 - Erythrobasidium-SSU-tree.tre: SSU基因片段ML分析生成的系统发育树 - Erythrobasidium-concat-tree.tre: 联合基因片段ML分析生成的系统发育树

适用场景

  • 真菌分类学研究: 用于桉生红基酵母新物种的分子鉴定与系统发育分析
  • 分子系统学分析: 支持基于ITS、LSU、SSU基因片段的真菌亲缘关系研究
  • 生物信息学方法验证: 可作为最大似然法系统发育分析的案例数据
  • 微生物多样性调查: 为相关环境中酵母物种的鉴定提供参考序列
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.02 MiB
最后更新 2025年11月26日
创建于 2025年11月26日
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