数据集概述
该数据集包含用于描述新种桉生红基酵母(Erythrobasidium eucalypti)的分子序列数据及系统发育分析结果,涉及ITS、LSU、SSU基因片段的比对文件与最大似然法(ML)分析生成的系统发育树文件,为该新物种的分类学鉴定提供分子依据。
文件详解
该数据集包含一个目录及8个文件,具体说明如下:
- 目录名称: Description of Erythrobasidium eucalypti R Knop., Hammerb., M. Groenew., & T Bose, sp. nov/
- 基因序列比对文件(.nex格式):
- Erythrobasidium-ITS-aln.nex: ITS基因片段的比对数据文件
- Erythrobasidium-LSU-aln.nex: LSU基因片段的比对数据文件
- Erythrobasidium-SSU-aln.nex: SSU基因片段的比对数据文件
- Erythrobasidium-concat.nex: ITS、LSU、SSU基因片段的联合比对数据文件
- 系统发育树文件(.tre格式):
- Erythrobasidium-ITS-tree.tre: ITS基因片段ML分析生成的系统发育树
- Erythrobasidium-LSU-tree.tre: LSU基因片段ML分析生成的系统发育树
- Erythrobasidium-SSU-tree.tre: SSU基因片段ML分析生成的系统发育树
- Erythrobasidium-concat-tree.tre: 联合基因片段ML分析生成的系统发育树
适用场景
- 真菌分类学研究: 用于桉生红基酵母新物种的分子鉴定与系统发育分析
- 分子系统学分析: 支持基于ITS、LSU、SSU基因片段的真菌亲缘关系研究
- 生物信息学方法验证: 可作为最大似然法系统发育分析的案例数据
- 微生物多样性调查: 为相关环境中酵母物种的鉴定提供参考序列