数据集概述
本数据集聚焦花朵微生物组(anthosphere)中的花瓣附生细菌群落,通过空间显性分析探究花瓣内微生物群落结构与功能的驱动因素。包含两种共开花植物(花瓣紫外线吸收模式不同)的细菌群落数据,涉及生长曲线、花朵年龄、碳利用、化学耐受性等多维度信息,共10个文件。
文件详解
- 原始数据文件
- 文件名称:Raw_Growth_Curve_Output.xlsx、Flowerhead_Age.csv、LD50Assay_RawData.csv
- 文件格式:XLSX、CSV
- 字段映射介绍:记录原始观测数据,包括花朵观测日期、植物唯一ID、生长曲线原始输出、LD50测定原始数据等基础信息
- 处理后数据文件
- 文件名称:GC_fit_summary.csv、BiologData.csv、TableS3_Isolates.csv、TableS4_ColonyTraits.csv、TableS3_References.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含生长曲线拟合结果(如浓度、可靠性、模型参数及置信区间)、Biolog碳利用数据、细菌分离株信息、菌落特征数据、参考文献信息等结构化分析数据
- 分析代码文件
- 文件名称:LD50_Assay_Code.Rmd、Biolog_NMDS_Code.Rmd
- 文件格式:Rmd
- 字段映射介绍:记录LD50测定分析、Biolog数据NMDS分析的代码逻辑与执行步骤
数据来源
论文“Spatially-explicit depiction of a floral epiphytic bacterial community reveals role for environmental filtering within petals”
适用场景
- 微生物群落空间分布研究:分析花瓣内附生细菌群落的空间异质性及其与环境因子(如紫外线吸收)的关联
- 环境过滤机制探究:验证花瓣环境过滤作用对附生细菌群落结构的影响
- 微生物功能特性分析:通过碳利用、化学耐受性数据研究细菌功能多样性与系统发育的关系
- 植物-微生物互作研究:探索花瓣微环境对细菌群落组装的驱动机制,为植物微生物组调控提供数据支持