数据集概述
该数据集围绕澳大利亚东南部 pygmy perches(Nannoperca australis 和 Nannoperca 'flindersi')的淡水系统地理模式展开,通过线粒体细胞色素b基因和23个多态性同工酶位点数据,检验大陆架宽度与河流流域间遗传分化程度的关联性假设。
文件详解
- 文档文件:
- README_for_spp.byhap.haponly2.pdf:PDF格式,可能为单倍型数据相关说明文档
- README_for_mtdna.dryad.submission.pdf:PDF格式,可能为线粒体DNA数据提交说明文档
- 序列数据文件:
- spp.byhap.haponly2.nex:NEXUS格式,可能为单倍型序列数据文件
- spp.cytb.all.final.paper.nex:NEXUS格式,可能为细胞色素b基因序列最终数据文件
- mtdna.dryad.submission.nex:NEXUS格式,可能为线粒体DNA提交用序列数据文件
- spp.shelf.hyp.bygroup.meg:MEGA格式,可能为按群体分组的大陆架假设相关序列数据文件
- spp.cytb.all.group.by.lineage.final.paper.meg:MEGA格式,可能为按谱系分组的细胞色素b基因序列最终数据文件
- 原始数据文件:
- SPP_Molec_Ecol_raw_allozyme_data.txt:TXT格式,原始同工酶数据文件,包含Fish、Population及多个同工酶位点(如Acon1、Ada、Ca等)的基因型数据
- 分析文件:
- spp.allgenes.StarBEAST.upgma.xml:XML格式,可能为StarBEAST分析用的UPGMA树相关配置文件
适用场景
- 淡水鱼类系统地理学研究:分析澳大利亚东南部 pygmy perches 的遗传分化模式
- 生物地理学假设验证:检验大陆架宽度对河流流域间遗传分化的影响
- 保护遗传学研究:评估 pygmy perches 种群遗传异质性及保护意义
- 分子生态学分析:探究淡水生物跨流域扩散与地理屏障的关联性
- 进化生物学研究:解析低海平面时期河流连通性对物种遗传结构的影响