数据集概述
本数据集为人类健康相关不良结局通路（AOPs）提供全面的分子注释，包含基因与关键事件（KEs）的关联、名称与ID映射、基因集注释、生物系统注释等结构化信息，支持将AOP框架嵌入分子数据解读，助力生物医学研究中基于AOP的新方法开发与应用。
文件详解
- Genes_to_KEs.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：记录关键事件（KE）与基因的关联，每行包含Event编号与对应的ENSG基因ID（如Event:10 ENSG00000175344）
- Name_to_ID_mapping.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：提供名称与ID的映射关系（具体字段基于文本内容，未展示完整预览）
- Genes_to_KEs.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：结构化存储关键事件与基因的关联数据（字段对应TXT文件的核心内容）
- Gene_set_annotations.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含基因集的注释信息（具体字段未展示，推测为基因集分类、功能描述等）
- Dictionary.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：数据集相关术语的字典解释（如AOP、KE等术语定义）
- Biological_system_annotations.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：生物系统的注释信息（具体字段未展示，推测为生物系统分类、功能关联等）
- aop_mapping_nlp.tar.gz
- 文件格式：GZ（压缩包）
- 字段映射介绍：包含AOP映射相关的自然语言处理（NLP）数据（压缩包内具体内容未展示）
数据来源
Zenodo平台，对应论文：Saarimäki, L.A., Fratello, M., Pavel, A. et al. A curated gene and biological system annotation of adverse outcome pathways related to human health. Sci Data 10, 409 (2023). https://doi.org/10.1038/s41597-023-02321-w
适用场景
- 不良结局通路机制研究: 分析基因与关键事件的关联，解析AOP从分子起始事件到不良结局的生物机制
- 化学安全性评估: 支持基于AOP的新方法（NAMs）开发，减少动物实验在化学安全评估中的应用
- 生物医学分子数据解读: 将AOP框架嵌入基因表达、蛋白质组等分子数据的功能注释与解读
- 基因集功能分析: 利用基因集注释数据研究特定基因集与AOP及人类健康的关联
- 生物系统功能关联研究: 通过生物系统注释数据探索生物系统与不良健康结局的关系
