数据集概述
本数据集为古啮齿动物科(Aplodontiidae)的分子系统发育研究数据,包含单一现存属Aplodontia(山狸)的线粒体与核基因序列分析结果,用于验证形态分类学的亚种划分假设,结合地理信息阐明主要进化支分布,支持部分亚种修订及保护建议。数据集含6个文件。
文件详解
- 附录表格文件(.xls/.xlsx格式)
- 文件名称:Appendix 1 cytb 1050bp 080612.xls、Appendix 2 cytb 450bp 080612.xls、Appendix 3 CR 080612.xls、Appendix 4 GHR 080612.xlsx
- 文件格式:XLS、XLSX
- 字段映射介绍:包含不同基因片段(细胞色素b、控制区、生长激素受体基因)的序列或分析数据,支撑分子系统发育研究的亚种划分与地理分布分析。
- XML元数据文件
- 文件名称:cytb prior root stdev mean CA.xml、all nuc.TXT.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:记录细胞色素b基因先验根信息及所有核基因数据的元数据,用于系统发育分析的参数设置与数据描述。
数据来源
论文“Molecular phylogeny of an ancient rodent family (Aplodontiidae)”
适用场景
- 啮齿动物系统发育研究: 分析Aplodontiidae科与松鼠类的亲缘关系及进化支分化。
- 亚种分类验证: 结合分子数据检验形态分类学的亚种划分假设,修订亚种分类体系。
- 生物地理分布分析: 整合地理信息阐明主要进化支的分布规律与边界。
- 保护生物学研究: 为濒危亚种(如加州沿海隔离种群)的保护状态评估与管理提供数据支持。
- 分子遗传学分析: 利用线粒体与核基因序列数据开展基因进化与种群遗传学研究。