数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了2012年2月9日开展的AQ2947品系(CGC N2,英国布里斯托)线虫的行为实验数据。实验由英国MRC分子生物学实验室完成,使用tierpsy软件追踪线虫在NGM培养基上的行为,包含视频处理后的特征数据、行为记录文件等,共3个文件。
文件详解
- 行为特征文件:
- 文件名称:
483 AQ2947 on food R_2012_02_09__12_13___4___5_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为追踪过程中提取的特征数据,基于tierpsy软件分析结果,包含23082个分割骨架数据。
- 行为记录压缩文件:
- 文件名称:
483 AQ2947 on food R_2012_02_09__12_13___4___5.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储线虫行为的wcon格式记录文件,包含实验时长(899秒)、帧率(30.03帧/秒)、像素分辨率(4.71459微米/像素)等基础参数。
- 实验数据文件:
- 文件名称:
483 AQ2947 on food R_2012_02_09__12_13___4___5.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验原始或处理后的核心数据,支持线虫行为的定量分析。
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 模式生物行为研究:分析秀丽隐杆线虫AQ2947品系的运动模式、觅食行为等基本行为特征。
- 行为遗传学分析:结合线虫品系背景,研究基因(本实验未涉及特定基因)或环境因素对行为的影响。
- 行为分析软件验证:用于验证tierpsy等线虫行为追踪软件的分析效果和数据处理逻辑。
- 实验方法复现:参考实验方案(Yemini et al.方法),复现或优化线虫行为实验流程。