数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)AQ908品系的行为实验数据,记录了携带mec-4(u253)突变及pmec-4::YC2.12转基因标记的成年雌雄同体线虫在NGM培养基上的行为表现,包含实验环境参数、视频采集信息及行为特征数据文件,用于研究mec-4基因相关的线虫行为机制。
文件详解
- 行为特征文件
- 文件名称:mec-4 (u253) on food L_2010_10_28__12_18_26__5_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,包含26652个分段骨架信息,记录线虫运动的空间形态特征
- 行为数据归档文件
- 文件名称:mec-4 (u253) on food L_2010_10_28__12_18_26__5.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩归档的线虫行为数据文件,包含实验过程中的原始行为记录
- 核心数据文件
- 文件名称:mec-4 (u253) on food L_2010_10_28__12_18_26__5.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验核心数据,关联视频采集参数(帧率30.03fps、像素分辨率4.56732微米/像素)及行为分析结果
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫行为遗传学研究:分析mec-4基因突变对秀丽隐杆线虫运动模式、行为节律的影响
- 神经生物学机制探索:结合转基因标记,研究机械感受基因相关的神经调控通路
- 实验方法验证:参考E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为实验的标准化流程
- 行为分析算法测试:利用分段骨架数据测试tierpsy等行为追踪软件的分析精度
- 环境对生物行为影响研究:分析NGM培养基、OP50食物条件下线虫的行为响应特征