数据集概述
本数据集为拟南芥同源多倍体、异源多倍体及其亲本的蛋白质组差异研究数据,通过iTRAQ定量技术结合质谱分析,探究多倍体化对蛋白质组的影响,包含蛋白质表达量变化、功能分类及非加性积累特征等核心内容。
文件详解
- README_for_11-Supp-Dataset 1.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:说明Excel文件"11-Supp-Dataset 1"包含的五个工作表(Legend key、At4-At2、Aa-At4、F1-MPV、F8-MPV),提供各数据列的导航指引与内容描述
- MS_spectra.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:记录iTRAQ标记的质谱数据,可从ProteomeCommons平台下载完整数据
- 11-Supp-Dataset 1.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:含五个工作表,Legend key为列信息说明;At4-At2、Aa-At4、F1-MPV、F8-MPV为不同材料组合(同源多倍体与二倍体、亲本种间、异源多倍体F1/F8与中亲值)的蛋白质差异数据
数据来源
论文“Proteomic divergence in Arabidopsis autopolyploids and allopolyploids and their progenitors”
适用场景
- 植物多倍体蛋白质组学研究: 分析同源/异源多倍体与亲本的蛋白质表达差异及非加性积累特征
- 多倍体化分子机制分析: 探究多倍体形成过程中转录后调控与蛋白质翻译修饰的变化
- 蛋白质功能分类研究: 解析非生物/生物胁迫相关蛋白质在多倍体中的表达模式
- 基因表达与蛋白质组关联分析: 对比基因表达数据与蛋白质组数据的一致性及差异