数据集概述
本数据集聚焦拟南芥根系结构对环境的响应机制，通过追踪氮处理和生物互作两种环境下根系发育的转录组动态，揭示基因表达的时空特异性及“响应非冗余性”机制。数据包含23个文件，涵盖基因网络、转录模块及家族基因调控等相关信息，为解析根系可塑性的分子基础提供支持。
文件详解
- .cys格式文件（共14个）
- 文件名称：如Supplemental File 3.cys、Supplemental File 7.cys等
- 文件格式：.cys
- 字段映射介绍：推测为基因网络或转录调控模块相关文件，可能包含基因互作关系、模块分类及调控路径等信息（具体字段需基于文件内容进一步确认）
- .xlsx格式文件（共9个）
- 文件名称：如Supplemental Dataset 6.xlsx、Supplemental Dataset 9.xlsx等
- 文件格式：.xlsx
- 字段映射介绍：推测为转录组数据或基因家族分析表格，可能包含基因表达量、差异表达结果、细胞类型特异性表达及环境响应基因列表等信息（具体字段需基于文件内容进一步确认）
数据来源
论文“Root architecture shaping by the environment is orchestrated by dynamic gene expression in space and time”
适用场景
- 植物根系发育分子机制研究：分析拟南芥根系在不同环境下的基因表达时空特异性，解析根系可塑性的调控基础
- 环境响应转录组分析：对比氮处理和生物互作下的转录组差异，探究“响应非冗余性”机制的分子逻辑
- 基因网络与模块功能研究：利用基因网络数据，挖掘调控根系发育的核心转录模块及关键基因
- 植物细胞类型特异性表达分析：结合细胞类型转录数据，揭示不同细胞类型在环境响应中的功能分工
