数据集概述
本数据集基于拟南芥意大利与瑞典本地适应种群杂交的重组自交系（RIL）群体，分析温室及亲本原生地田间环境下种子休眠的遗传结构，检测到9个数量性状位点（QTL），揭示母本环境对休眠遗传基础的影响，含3个相关文件。
文件详解
- 文档文件
- 文件名称：README_for_RILgeno_phenotypes.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：提供RIL群体基因型与表型数据的说明文档，包含实验背景、数据采集方法及文件使用指南等内容
- 代码文件
- 文件名称：Seeddormancy_QTLanalysis.R
- 文件格式：R
- 字段映射介绍：用于种子休眠数量性状位点（QTL）分析的R语言代码，包含数据处理、QTL定位及结果可视化的程序逻辑
- 数据文件
- 文件名称：RILgeno_phenotypes.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含RIL群体编号（id）、不同环境下的休眠表型数据（温室GHwk1、意大利田间ItF12、瑞典田间SwF12）、亲本来源标记（parC）、二分类表型（GHwk1_bin等）、亚组表型（SwF12_sub等）及多个基因型位点标记（如1_371484）等字段
数据来源
论文“Maternal environment affects the genetic basis of seed dormancy in Arabidopsis thaliana”
适用场景
- 植物适应性遗传机制研究: 分析母本环境对拟南芥种子休眠遗传结构的影响，探究适应性性状的遗传基础
- 数量性状位点（QTL）定位: 利用RIL群体基因型与表型数据，定位调控种子休眠的关键遗传位点
- 基因-环境互作分析: 研究种子基因型与母本环境的互作效应，揭示环境对休眠遗传表达的调控作用
- 植物繁殖策略进化研究: 基于不同环境下的休眠水平差异，分析拟南芥种子休眠策略的进化适应性
- 分子标记辅助育种: 利用检测到的休眠相关QTL及候选基因（如DOG1），为作物种子休眠性状的分子改良提供参考
