数据集概述
本数据集为古柯属Archerythroxylum组的系统发育研究数据，通过杂交捕获427个基因，使用串联和基因树 reconciliation方法构建系统发育树，分析种类关系、生物地理学及驯化历史。数据包含样本信息、基因序列比对和系统发育树文件，共3个文件，支持古柯属分类修订与驯化起源研究。
文件详解
- 样本信息文件：
- 文件名称：White_Archerythroxylum_SampleInfo.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含古柯属Archerythroxylum组系统发育研究的样本基本信息（具体字段未提供预览，推测为样本编号、物种名称、采集信息等）
- 基因序列比对文件：
- 文件名称：alignments.tar.gz
- 文件格式：TAR.GZ（压缩包）
- 字段映射介绍：包含427个基因的杂交捕获序列比对数据
- 系统发育树文件：
- 文件名称：trees.tar.gz
- 文件格式：TAR.GZ（压缩包）
- 字段映射介绍：包含通过串联和基因树 reconciliation方法构建的系统发育树结果
数据来源
论文“Phylogenetic inference in section Archerythroxylum informs taxonomy, biogeography, and the domestication of coca (Erythroxylum species)”
适用场景
- 植物系统发育研究: 用于分析古柯属Archerythroxylum组的种类亲缘关系与分类修订
- 生物地理学分析: 结合系统发育树与地理分布数据，探究古柯属的地理演化历史
- 作物驯化起源研究: 解析栽培古柯（E. coca、E. novogranatense）与野生近缘种的亲缘关系，验证驯化假说
- 分子系统学方法应用: 评估杂交捕获基因、串联与基因树 reconciliation方法在古柯属系统发育分析中的有效性
