数据集概述
本数据集基于26个湖泊沉积物岩心样本的古DNA宏条形码分析,覆盖西伯利亚、白令陆桥及阿拉斯加区域,记录末次冰期至间冰期过渡阶段北极-北方苔藓植物的动态变化。包含苔藓植物DNA序列、重采样百分比数据、气候数据及分析脚本,共6个文件,支持古生态学与生物地理研究。
文件详解
- 数据文件
- 文件名称:Bryophytes_data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:R脚本使用的基础数据文件,包含苔藓植物相关原始数据
- 文件名称:2025-01-14_bryophyta_resampled_percentages_mean_100runs_sequences.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:按千年时间切片重采样的苔藓植物ASV(扩增子序列变体)百分比数据,含时间切片及各ASV百分比字段
- 文件名称:2025-01-14_bryophyta_resampled_percentages_mean_100runs_scientific_names.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:按千年时间切片重采样的苔藓植物学名水平百分比数据,含时间切片及各物种学名百分比字段(如Chiloscyphus_polyanthos、Andreaea_nivalis等)
- 文件名称:2025-01-14_gbif_taxa_occurrences_seqtypes_climate.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:整合GBIF分类群分布数据与气候数据的文件,含核苷酸序列、记录类型、纬度、经度、分类阶元(界、门、纲等)及气候相关字段
- 气候数据文件
- 文件名称:wc2.1_30s_bio_10.tif
- 文件格式:TIF
- 字段映射介绍:WorldClim 2.0数据集的最暖季度平均温度栅格数据,分辨率30秒
- 分析脚本
- 文件名称:2025-01-14_R-Script_ arctic_boreal_bryophyte_dynamics_DNA_metabarcoding.R
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:用于分析苔藓植物动态的R脚本,包含数据处理、重采样及关联气候数据的代码逻辑
适用场景
- 古生态学研究:分析末次冰期以来北极-北方苔藓植物群落组成的时空动态
- 生物地理研究:探究苔藓植物在冰期-间冰期过渡阶段的分布格局与迁移路径
- 气候-植被关系分析:结合最暖季度温度数据,揭示气候变迁对苔藓植物动态的影响
- 古DNA方法验证:验证古DNA宏条形码技术在苔藓植物古生态研究中的应用效果