数据集概述
本数据集源自博士论文,聚焦北极十字花科植物(Cardamine bellidifolia、Cochlearia groenlandica、Draba nivalis)的适应性分子模式研究。通过三篇论文(Papers I-III)分析基因层面的适应性轨迹、冷响应转录组特征及基因组演化,包含30个数据文件,主要为Excel表格,支撑北极植物适应性的分子证据探索。
文件详解
- 数据文件(Excel表格)
- 文件名称示例:Paper1_Table_S7-S9_-_Arctic_DAVID_Annotations_PSGs.xlsx、Paper2_TableS24_PSGs_in_24DEGs.xlsx、Paper2_TableS14_Cbellidifolia_ELIM_BP.xlsx等
- 文件格式:XLSX(27个)、XLS(3个)
- 字段映射介绍:包含正选择基因(PSGs)的功能注释、差异表达基因(DEGs)关联分析、基因本体(GO)富集结果、BLAST比对结果、候选适应基因列表等内容,覆盖北极植物适应性相关的基因功能、转录响应及基因组特征数据。
数据来源
博士论文“PhD Thesis: Tracing Molecular Patterns of Adaptation in Arctic Brassicaceae”
适用场景
- 植物进化生物学研究:分析北极十字花科植物适应性的分子轨迹与遗传机制。
- 极端环境适应性研究:探索植物对北极低温、强光等极端环境的基因层面适应策略。
- 比较基因组学分析:基于Draba nivalis基因组数据,开展十字花科植物基因组演化对比研究。
- 转录组学研究:利用冷响应转录组数据,解析北极植物与温带植物(如拟南芥)的基因表达差异。
- 基因功能注释研究:通过正选择基因的功能注释数据,挖掘北极适应性相关的关键基因家族。