数据集概述
本数据集为广布古北区物种Argiope bruennichi(黄蜂蜘蛛)的系统地理学调查数据,覆盖亚速尔群岛、马德拉群岛、欧洲、北非及亚洲等古北区区域。数据基于核DNA、线粒体DNA标记及形态特征,结合物种分布模型分析其冰期避难所与冰后期基因流模式,共包含6个文件。
文件详解
- 核DNA序列文件(.fas格式)
- 文件名称:SA24_nuclear.fas、SA11_nuclear.fas
- 内容说明:蜘蛛样本的核DNA序列数据,用于种群遗传分化分析
- 线粒体DNA序列文件(.fas格式)
- 文件名称:COI_Aignment_Azores_Madeira.fas
- 内容说明:亚速尔群岛、马德拉群岛种群的COI基因序列比对数据,用于谱系地理分析
- 样本清单文件(.xls格式)
- 文件名称:Sample list.xls
- 内容说明:研究涉及的蜘蛛样本基本信息,包括采样地点、编号等元数据
- 微卫星数据文件(.txt格式)
- 文件名称:Microsatellite_Data.txt
- 内容说明:包含样本来源(如东亚)、标本编号及微卫星位点(如3+4、5+6等)的基因型数据
- 引物序列文件(.xlsx格式)
- 文件名称:Primer_Sequences.xlsx
- 内容说明:实验所用核DNA、线粒体DNA标记的引物序列信息
数据来源
论文“A phylogeographical survey of a highly dispersive spider reveals eastern Asia as a major glacial refugium for Palaearctic fauna”
适用场景
- 古北区动物区系冰期避难所研究:分析东亚作为古北区物种冰期避难所的遗传证据
- 蜘蛛种群遗传分化分析:利用核DNA、线粒体DNA数据解析Argiope bruennichi的谱系地理结构
- 物种分布模型验证:结合遗传数据与分布模型结果,探究冰期-间冰期物种分布动态
- 生物地理学研究方法应用:为广布物种的系统地理学调查提供多标记(遗传+形态)整合分析的参考案例
- 种群基因流模式分析:基于微卫星数据揭示古北区不同地理种群的基因交流历史