数据集概述
本数据集围绕贝尔麻雀与艾草麻雀(Artemisiospiza属)的鸣声分化展开,包含鸣声特征、线粒体DNA序列、生物气候变量及地理信息等数据,用于分析鸣声与遗传、表型的一致性,以及生态环境对鸣声进化的驱动作用,涉及多个亚种及地理种群的对比研究。
文件详解
- 文档文件(Document files)
- 文件名称:
README_for_SongLibrary.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:鸣声库相关说明文档,可能包含数据采集方法、字段定义等背景信息
- 文件名称:
README_for_Amphispiza_loc_worldclim_forPCA.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:地理与生物气候数据主成分分析(PCA)的说明文档,解释数据来源与分析逻辑
- 数据文件(Data files)
- 文件名称:
SongLibrary.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含GroupName(分组名)、Subspecies(亚种)、GeneticGroup(遗传组)、Locality( locality)、GPS(坐标)、RecordingNumber(记录编号)、Duration(时长)、LowFreq(最低频率)、HighFreq(最高频率)、FreqRange(频率范围)、nNotes(音节数)、nNoteTypes(音节类型数)、NotesPerSecond(每秒音节数)、ProportionTrills(颤音比例)、ProportionChevrons(V型音节比例)、ProportionUpsweep(升频音节比例)等鸣声特征字段
- 文件名称:
Amphispiza_loc_worldclim_forPCA.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含X/Y(坐标)、FID_(要素ID)、INSTITUTIO(机构)、CAT_NUM(标本号)、GENUS/SPECIES/SUBSPECIES(分类信息)、HAPLOTYPE(单倍型)、STATE_PROV/COUNTY/LOCALITY(地理信息)、DECLAT/DECLONG(经纬度)、bio_16_usc/bio_3_uscl/bio_9_uscl(生物气候变量)等地理与环境数据字段
- 文件名称:
songData_filled.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:补充后的鸣声数据文件,可能包含完整的鸣声特征记录
- 遗传数据文件(Genetic data files)
- 文件名称:
CytB.phy
- 文件格式:PHY
- 字段映射介绍:细胞色素b(CytB)基因的系统发育数据文件,包含物种的DNA序列信息
- 文件名称:
ND2.phy
- 文件格式:PHY
- 字段映射介绍:ND2基因的系统发育数据文件,包含物种的线粒体DNA序列信息
- 代码文件(Code files)
- 文件名称:
Artemesiospiza.R
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:R语言分析脚本,可能用于鸣声特征、遗传数据或生态变量的统计分析与可视化
数据来源
- 论文“The role of history and ecology as drivers of song divergence in Bell's and Sagebrush sparrows (Artemisiospiza, Aves: Passerellidae)”
适用场景
- 鸟类鸣声进化研究:分析Artemisiospiza属麻雀鸣声特征与遗传、表型的关联,探究鸣声分化的驱动因素
- 生态环境对生物性状的影响分析:利用生物气候变量与鸣声数据,研究干旱/开阔生境对鸟类鸣声的选择作用
- 物种分类与系统发育验证:结合线粒体DNA序列与鸣声特征,辅助Artemisiospiza亚种的分类学修订
- 生物声学与环境适应研究:通过鸣声频率、音节结构等参数,探讨声学环境对鸟类鸣声表型的塑造机制
- 地理种群分化研究:对比不同地理种群(如圣华金谷、莫哈韦沙漠、圣克莱门特岛)的鸣声与遗传差异,揭示种群分化过程