数据集概述
本数据集基于鹰嘴豆两个重组自交系群体(AB3279和AB482)的基因分型与表型数据,通过GBS技术鉴定与Ascochyta枯萎病抗性相关的基因组区域及QTL。共识别21个抗性相关区域,包含1118个显著关联SNP,涉及319个抗病相关基因,为鹰嘴豆抗病育种提供分子标记支持。
文件详解
- 基因型数据文件(CSV格式)
- 文件名称:Genotype AB3279.hmp - all.csv、Genotype AB482.hmp.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含rs#(SNP编号)、alleles(等位基因)、群体样本ID(如AB5_10、ILC1929等),记录各样本的SNP基因型信息
- 基因型数据文件(XLSX格式)
- 文件名称:Genotype AB3279_Final_SNPs_for_mapping.xlsx、Genotype AB482_Final_SNPs_for_mapping.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:用于定位的最终SNP数据集,包含与抗病性关联的标记信息
- 表型数据文件
- 文件名称:Phenotype.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:记录鹰嘴豆在不同环境下的Ascochyta枯萎病抗性表型评价数据
数据来源
论文“Novel Genomic Regions linked to Ascochyta blight Resistance in two differentially resistant cultivars of chickpea”
适用场景
- 鹰嘴豆抗病基因定位研究: 分析与Ascochyta枯萎病抗性相关的QTL及候选基因功能
- 作物分子育种应用: 利用显著关联的SNP标记开发分子辅助选择工具,加速抗病品种培育
- 植物病理机制研究: 探究LRR抗性基因家族、转录因子等在鹰嘴豆抗枯萎病中的作用机制
- 农业生物技术优化: 基于基因组区域信息优化鹰嘴豆抗病性遗传改良策略