数据集概述
本数据集包含蚊子寄生虫Ascogregarina taiwanensis相关的转录组数据和实验分析结果，涉及蚊子与寄生虫的基因表达、代谢通路分析等内容，旨在研究该寄生虫的共生特性及其对蚊子产卵的影响。数据集共有29个文件，涵盖转录组元数据、差异表达基因分析、代谢通路分析等多种类型。
文件详解
- 转录组元数据文件
- 文件名称：Metadata_denovo_transcriptome.xlsx、Metadata_mosquito_transcriptome.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含蚊子和寄生虫转录组的元数据信息，可能涉及样本来源、实验条件等内容
- 基因表达分析文件
- 文件名称：DEG_Mosquito_transcriptome.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含蚊子转录组的差异表达基因（DEG）分析结果，涉及基因表达量变化等信息
- 代谢通路分析文件
- 文件名称：Pathways_NF_unparasitized.tsv、Pathways_FE_unparasitized.tsv、Pathways_G3_parasitized.tsv、Pathways_denovo_Ascogregarina_NF.xlsx等
- 文件格式：TSV、XLSX
- 字段映射介绍：包含蚊子和寄生虫的代谢通路分析结果，涉及通路ID、名称、背景基因数、结果基因数、基因列表、富集倍数、P值等信息
- 基因功能对应文件
- 文件名称：Correspondance_genes_functions_mosquito.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含蚊子基因ID、来源ID、输入顺序、物种、基因组位置、产物描述、基因类型等字段
- 转录组BLAST结果文件
- 文件名称：Ascogregarina_denovo_transcriptome_BLAST.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含寄生虫转录组的BLAST比对结果信息
- 映射特征计数报告文件
- 文件名称：Mapping_featureCounts_report.tabular
- 文件格式：TABULAR
- 字段映射介绍：包含转录组映射的特征计数报告信息
数据来源
论文“Friend or foe: A mosquito parasite with mixed transmission mode displays mutualistic traits promoting oogenesis”
适用场景
- 寄生虫共生特性研究: 分析Ascogregarina taiwanensis的共生特性及其对蚊子产卵的影响机制
- 基因表达分析: 研究蚊子和寄生虫在不同条件下的基因表达变化
- 代谢通路研究: 分析蚊子和寄生虫的代谢通路及其在共生过程中的作用
- 基因功能注释: 利用基因功能对应文件进行蚊子基因的功能注释与分析
- 转录组数据分析: 基于转录组数据进行差异表达基因、通路富集等生物信息学分析
