数据集概述
本数据集为论文“新型FAD依赖单加氧酶对乙酰丁香酮的分解代谢及2,4,6-三氯苯酚的共代谢降解”的补充数据,包含实验筛选、单化合物降解、菌株代谢、诱导实验、基因数据库、质谱检测等相关文件,对应论文中的多个图表及补充材料,总计8个文件。
文件详解
screening_rca_data.csv(CSV格式):细菌 consortium ASC12在混合化合物筛选实验中对选定APs和CPs的降解数据,对应论文图1。
individual setup.csv(CSV格式):细菌 consortium ASC12在单化合物实验中对CPs的降解数据,对应论文图1。
AS1_26-DCP_246-TCP.csv(CSV格式):菌株AS1对2,6-DCP和2,4,6-TCP的降解数据,对应论文图3。
Induction_data.xlsx(XLSX格式):诱导实验数据,对应论文图6及补充材料图2。
ASD_DB.xlsx(XLSX格式):本地基因数据库,包含S-木质素衍生化合物和CPs细菌分解代谢相关基因的蛋白序列及同源序列。
LC_MS_nontarget.rar(RAR格式):LC-MS检测数据,对应论文图7和图8。
asdB_C_A_D_ASdeg.csv(CSV格式):携带asdB、asdC、asdA或asdD基因的大肠杆菌对AS的降解测试数据。
README.txt(TXT格式):数据集导航说明,解释各文件对应论文中的图表。
数据来源
论文“Catabolism of Acetosyringone and Co-metabolic Degradation of 2,4,6-Trichlorophenol by a Novel FAD-dependent Monooxygenase”
适用场景
- 微生物代谢机制研究:分析新型FAD依赖单加氧酶对目标化合物的分解代谢及共代谢降解过程。
- 污染物降解效率评估:通过筛选及单化合物实验数据,评估细菌 consortium及菌株对APs和CPs的降解能力。
- 基因功能验证:利用基因数据库及大肠杆菌表达实验数据,验证相关基因在代谢中的作用。
- 代谢产物分析:通过LC-MS数据鉴定代谢过程中的产物,辅助解析降解路径。
- 诱导调控研究:基于诱导实验数据,探究代谢过程中的诱导机制及关键影响因素。