数据集概述
本数据集源自黄曲霉与寄生曲霉种间杂交实验研究,包含88个相关文件,涉及杂交菌株的基因型分析、基因组杂交数据、真菌毒素检测结果及系统发育分析等内容,旨在探究种间杂交对真菌多样性及产毒特性的影响,为农业真菌毒素污染防控提供数据支持。
文件详解
- 元数据文件
- 文件名称:OLARTE_metadata_updated_9.30.14.xls
- 文件格式:XLS
- 字段映射介绍:包含实验相关的元数据信息
- 基因芯片数据文件
- 文件名称:如EA08090_115513_AFLAVUSA520391F_1C3655.CEL等56个.CEL文件
- 文件格式:CEL
- 字段映射介绍:基因芯片原始数据文件
- 提交信息文件
- 文件名称:如Submission1628464.txt等8个.TXT文件
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含实验提交相关的文本信息,如LOCUS、DEFINITION、ACCESSION等序列相关信息
- 表格数据文件
- 文件名称:Table 3 Final mycotoxins.xlsx、Table 2 Sclerotial weight.xlsx、Table 2 Colony dia.xlsx等7个.XLSX文件
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含真菌毒素检测结果、菌核重量、菌落直径等实验数据
- 系统发育分析文件
- 文件名称:RAxML_bipartitionsBranchLabels.MLST_3_loci
- 文件格式:MLST_3_LOCI
- 字段映射介绍:多基因座系统发育分析结果文件
- 序列比对文件
- 文件名称:GMLST_alignment_278x65.nxs、GMLST_alignment_278x324.nxs、CMLST_alignment_278x33.nxs等9个.NXS文件
- 文件格式:NXS
- 字段映射介绍:基因组多基因座序列比对文件
- 可视化数据文件
- 文件名称:global_species_iTOL_NEW.csv、global_locality_iTOL_NEW.csv、Global_Gs.csv等4个.CSV文件
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含物种、地理位置等相关的可视化数据
- 热图及树状图数据文件
- 文件名称:figure5_heatmap_data_log_transformed_loess_normalized_09302014.xlsb、dendrogram_data_log_transfored_unnormalized_09302014.xlsb
- 文件格式:XLSB
- 字段映射介绍:热图数据(经对数转换、loess归一化)及树状图数据(经对数转换、未归一化)
数据来源
标题为“Data from: Enhanced diversity and aflatoxigenicity in interspecific hybrids of Aspergillus flavus and Aspergillus parasiticus”的研究
适用场景
- 真菌种间杂交研究: 分析黄曲霉与寄生曲霉种间杂交的可行性及杂交后代的特性
- 真菌毒素研究: 探究杂交菌株的毒素合成能力及毒素谱变化
- 农业污染防控: 为农业中黄曲霉毒素等真菌毒素的污染防控提供理论依据和数据支持
- 分子遗传学研究: 基于基因芯片数据及序列比对结果,开展真菌分子遗传学相关研究
- 系统发育分析: 利用系统发育分析文件,研究真菌的进化关系及分类地位