数据集概述
本数据集为提交至《Environmental DNA》期刊的巨型淡水小龙虾(Astacopsis gouldi)环境DNA检测研究的补充数据,包含两类扩增数据:一是通过qPCR检测A. gouldi的CT值扩增元数据,二是初始质量控制中eDNA样本抑制试验的CT值元数据,对应两份独立补充材料。
文件详解
- 文件名称:Amplification metadata.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含巨型淡水小龙虾(A. gouldi)qPCR扩增的CT值数据,涉及样本(含阴性提取空白、现场及阴性对照)的三重重复检测结果,记录符合阳性判定标准(CT值≤55且扩增跨越阈值)的样本信息。
- 文件名称:Inhibition tests metadata.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含环境DNA样本抑制试验的CT值数据,记录通过稀释及加标DNA测试进行抑制检测的结果,涉及样本三重重复检测及多次qPCR重测的判定信息。
数据来源
提交至《Environmental DNA》期刊的论文“Environmental DNA detection of the giant freshwater crayfish (Astacopsis gouldi)”
适用场景
- 淡水生态物种监测: 利用qPCR扩增数据识别巨型淡水小龙虾的分布,评估其种群存在情况。
- 环境DNA检测方法优化: 分析抑制试验数据,优化eDNA样本质量控制流程及抑制消除策略。
- 水生生物保护研究: 基于阳性检测结果,为巨型淡水小龙虾的栖息地保护及种群管理提供数据支持。
- qPCR检测技术应用: 参考样本重复检测及判定标准,完善eDNA检测中qPCR实验的质量控制规范。