数据集概述
本数据集围绕墨西哥丽脂鲤洞穴鱼(Astyanax mexicanus)的白化病遗传机制展开,包含米科斯洞穴圈养种群白化病相关的原始图像、色素测量统计、qPCR数据等资料,用于研究不同演化历史洞穴种群白化病的共同Oca2基因起源。
文件详解
- 原始鳍夹照片压缩包
- 文件名称:Raw fin clip photographs.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含墨西哥丽脂鲤洞穴鱼鳍夹的原始照片,用于观察色素表型特征
- 色素测量描述性统计文件
- 文件名称:Descriptive Statistics Coloration Measurements.xls
- 文件格式:XLS
- 字段映射介绍:记录色素测量的统计分析数据,反映洞穴鱼的色素表型量化结果
- 原始qPCR测量文件
- 文件名称:Raw qPCR measures.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含qPCR实验的原始数据,用于分析相关基因的mRNA表达水平
- 原始滤光图像压缩包
- 文件名称:Raw filter images.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含经过滤光处理的原始图像,用于色素相关的图像分析
- 原始滤光图像及网格压缩包
- 文件名称:Raw filter images + grids.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含带网格标记的原始滤光图像,辅助色素测量的定位与分析
- 原始滤光色素测量文件
- 文件名称:Raw Filter Coloration Measurements.xls
- 文件格式:XLS
- 字段映射介绍:记录基于滤光图像的色素测量原始数据,用于量化分析色素特征
数据来源
论文“Albinism in phylogenetically and geographically distinct populations of Astyanax cavefish arises through the same loss-of-function Oca2 allele”
适用场景
- 洞穴鱼类白化病遗传机制研究:分析Oca2基因在不同演化历史洞穴种群白化病中的作用
- 生物表型与基因型关联分析:结合色素测量数据与基因序列/表达数据,探究表型-基因型关系
- 进化遗传学研究:研究祖先群体遗传变异在后代洞穴种群适应性演化中的保留与传递
- 基因表达调控分析:利用qPCR数据研究Oca2基因及相关通路的表达调控模式
- 生物图像表型分析:基于原始图像与滤光图像,开发或验证生物表型的图像分析方法