数据集概述
本数据集为冠顶灌丛雀（Atlapetes personatus）的系统地理学研究数据，包含线粒体DNA和核基因序列分析相关文件，涉及委内瑞拉平顶山区（Pantepui）种群的遗传结构、分化及基因流等研究内容，共17个文件，用于揭示该物种在"天空岛"生境中的演化分化模式。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称：Barrowclough_2022_Atlapetes_metadata.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：研究相关元数据文档，可能包含样本信息、实验设计等内容
- 说明文件
- 文件名称：README.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：数据集说明文件，包含研究背景、数据来源及文件清单等信息
- 遗传分析参数文件
- 文件名称：Atlapetes_personatus_BPP.ctl、Atlapetes_personatus_MIGRATE_parmfile_7pops_4genes_exponential-priors_10M_MCMCsteps、Atlapetes_personatus_BPP.Imap
- 文件格式：TXT/无后缀
- 字段映射介绍：BPP和MIGRATE等遗传分析软件的参数配置文件，包含种群划分、模型设置等信息
- 遗传数据文件
- 文件名称：Atlapetes_personatus_mtDNA_1Group.arp、Atlapetes_personatus_mtDNA_3Groups.arp、Atlapetes_personatus_E2F8_3Groups.arp、Atlapetes_personatus_G3P_1Group.arp、Atlapetes_personatus_ACO1_3Groups.arp、Atlapetes_personatus_4genes_mt-ACO-E2F8-GAPDH_BPP_input.txt
- 文件格式：ARP/TXT
- 字段映射介绍：包含线粒体DNA（mtDNA）及核基因（ACO1、E2F8、G3P等）序列数据，用于种群遗传结构和分化分析
- 分析项目数据
- 文件名称：Atlapetes_personatus_STRUCTURE_project_data、Atlapetes_personatus_MIGRATE_infile_7pop_4gene
- 文件格式：无后缀
- 字段映射介绍：STRUCTURE和MIGRATE软件的输入数据文件，包含多基因联合分析的种群遗传数据
数据来源
论文“Phylogeography of the tepui brush finch, Atlapetes personatus (Passeriformes: Passerellidae): Extensive differentiation on the sky islands of the Venezuelan Pantepui”
适用场景
- 鸟类系统地理学研究: 分析冠顶灌丛雀在委内瑞拉平顶山区的种群遗传结构和演化分化模式
- 生物多样性保护: 基于遗传分化结果，为该物种的保护单元划分提供科学依据
- 岛屿生物地理学研究: 探讨"天空岛"生境对鸟类种群分化和基因流的影响机制
- 遗传数据分析方法验证: 用于测试和验证BPP、MIGRATE等遗传分析软件的参数设置和分析流程
