数据集概述
本数据集为新西兰Atriophallophorus属吸虫寄生虫研究的配套数据，包含SNP数据、样本信息、系统发育分析结果、序列比对文件及分析输入文件，支持研究该属寄生虫的系统发育地理格局与隐存种结构，共含17个文件。
文件详解
- 数据文件（.fasta格式，共8个）
- 文件名称示例：Atriophallophorus_spp._NZ_ITS2.fasta、Atriophallophorus_spp._NZ_NADH5.fasta
- 内容：包含NADH5、28S、ITS2、COI等基因序列比对数据，覆盖寄生虫样本的分子序列信息
- 分析输入文件（.xml格式，共7个）
- 文件名称示例：Atriophalloporus_MASCOT.xml、BFD_Model_1.xml
- 内容：BEAST2软件MASCOT分析及BFD模型的输入配置文件，用于系统发育分析
- 系统发育树文件（.nex格式，共1个）
- 文件名称：ND5_BayesianPhylogeny.nex
- 内容：基于NADH5基因的贝叶斯系统发育树结果
- 综合数据文件（.xlsx格式，共1个）
- 文件名称：DryadData_Atriophallophorus.xlsx
- 内容：包含SNP数据、样本信息及MASCOT系统发育地理分析输出结果
数据来源
论文“Phylogeography and Cryptic Species Structure of a Locally Adapted Parasite in New Zealand”
适用场景
- 寄生虫分子系统发育研究：利用序列比对数据分析Atriophallophorus属寄生虫的系统发育关系
- 隐存种结构分析：通过分子数据识别寄生虫的隐存种及种群分化模式
- 系统发育地理格局研究：结合MASCOT分析结果探究南阿尔卑斯山脉与更新世冰川作用对寄生虫地理分布的影响
- 分子进化模型验证：使用BFD模型输入文件比较不同进化模型的拟合效果
- 寄生虫种群遗传学分析：基于SNP数据与样本信息研究寄生虫的种群遗传多样性与结构
