数据集概述
本数据集围绕澳大利亚喜鹊羽毛颜色形态变异的遗传力展开,基于1993-2010年在维多利亚州Seymour杂交区的长期观测与DNA样本,通过亲子鉴定分析538只喜鹊的亲子关系,采用加权中亲回归和动物模型估算羽毛颜色遗传力,探究遗传与环境因素对性状的影响。
文件详解
- 文档类
- 文件名称:README_for_HDY-18-AO311 Microsatellite genotype data.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:微卫星基因型数据的说明文档,提供数据集背景、使用方法等信息
- 数据类
- 文件名称:HDY-18-AO311 Microsatellite genotype data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含澳大利亚喜鹊个体的微卫星基因型数据,用于亲子关系鉴定
- 文件名称:HDY-18-AO311 Back colour morph scores for genetically assigned family groups.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:经遗传鉴定的家庭组对应的羽毛颜色形态评分数据,评分范围0-4
- 文件名称:HDY-18-AO311 Back colour morph scores.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:所有个体的羽毛颜色形态评分数据,包含个体ID、颜色评分等字段
- 文件名称:phenotypestxt.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:表型数据文件,包含animal(个体ID)、BC(颜色评分)、YEARBIRTH(出生年份)、TERRITORY(领地)等字段
- 文件名称:pedigreetxt.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:系谱数据文件,记录个体间的亲子关系信息
- 代码类
- 文件名称:HDY-18-AO311 animal model R script.R
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:用于运行动物模型估算遗传力的R脚本,包含数据处理、模型构建与分析代码
数据来源
论文“Heritability of plumage colour morph variation in a wild population of promiscuous, long-lived Australian magpies”
适用场景
- 野生动物遗传研究:分析澳大利亚喜鹊羽毛颜色形态的遗传力,探究遗传因素对性状的影响
- 进化生物学研究:研究羽毛颜色多态性在物种多样性维持中的进化意义
- 数量遗传学分析:利用动物模型和加权中亲回归方法,开展复杂性状的遗传参数估算
- 行为生态学研究:结合领地、出生年份等环境因素,分析非遗传因素对羽毛颜色性状的影响
- 分子生态学研究:基于微卫星基因型数据,开展亲子关系鉴定与种群遗传结构分析