AutoNetCan生物分子网络构建案例研究数据集

数据集概述

本数据集是AutoNetCan自动化网络服务器的案例研究数据,包含生物分子节点获取、富集分析、网络构建、逻辑规则、网络指标及多癌种(如乳腺、肺、卵巢等)的临床与实验数据,为转化癌症系统生物学研究提供支持。

文件详解

该数据集由多个目录和文件组成,具体说明如下: - 核心数据文件(CSV格式为主): - pathway_information.csv:分布于各Node Enrichment目录下,记录基因富集分析的通路信息 - Cytoscape.csv:位于Logical Rules目录,包含节点间相互作用数据,字段有Source Node、Target Node、Interaction Type等 - Global_Metrics.csv:位于Network Metrics目录,记录网络全局指标,字段包括num_nodes、num_edges、density等 - 文档说明文件(TXT格式): - readme.txt:分布于Clinical Trials、Experimental Therapies等目录,提供数据说明 - TISON_Rules.txt:位于Logical Rules目录,记录基因逻辑规则表达式 - 对比分析文件(XLSX格式): - Comparison_of_Nodes_Breast_Cancer.xlsx:位于Case Study Comparison目录,对比乳腺癌节点数据 - Comparison_of_Edges_Breast_Cancer.xlsx:位于Case Study Comparison目录,对比乳腺癌边数据

适用场景

  • 癌症系统生物学研究:分析不同癌种(乳腺、肺、卵巢等)的生物分子网络特征
  • 基因富集分析:探究差异表达基因、突变频率基因在通路中的富集情况
  • 临床转化研究:关联生物分子网络与临床实验、FDA批准药物数据
  • 网络生物学分析:计算和比较生物分子网络的拓扑结构与全局指标
  • 逻辑规则挖掘:基于基因互作数据构建和验证癌症相关的逻辑规则模型
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 269.95 MiB
最后更新 2025年11月27日
创建于 2025年11月27日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。