数据集概述
本数据集基于Avida数字进化平台,记录宿主与寄生虫协同进化实验的结果,包含宿主复杂性状形成、可进化性变化及相关遗传与表型数据,共11个文件,用于验证协同进化对生物复杂性和可进化性的驱动作用。
文件详解
- 数据文件(CSV格式,共9个)
- 示例文件:
coevolving-complexity-time_to_MRCA.csv
- 字段:Treatment(处理组)、Replicate(重复实验编号)、UpdateLCABorn(最近共同祖先出现的更新步数)、lost_parasites(丢失的寄生虫数量)
- 示例文件:
coevolving-complexity-replay_parasites.csv
- 字段:update(进化更新步数)、replicate(重复实验编号)、num_parasites(寄生虫数量)、num_hosts(宿主数量)、host_max_task_nands(宿主最大NAND任务数)、average_number_of_host_tasks(宿主平均任务数)、average_number_of_parasite_tasks(寄生虫平均任务数)、lost_parasites(丢失的寄生虫数量)
- 其他CSV文件:包含祖先基因型、挑战数据、冻结寄生虫记录、优势基因型景观分析等相关数据
- 压缩文件(共2个)
coevolving-complexity-details_and_phenotype_grids.tar.gz:格式为.gz,包含详细数据及表型网格文件
coevolving-complexity-config_files.zip:格式为.zip,包含实验配置文件
数据来源
论文“Coevolution drives the emergence of complex traits and promotes evolvability”
适用场景
- 协同进化机制研究: 分析宿主与寄生虫相互作用对复杂性状形成的驱动作用
- 生物复杂性进化分析: 验证协同进化如何提升生物表型与基因型的复杂性
- 可进化性机制研究: 探究协同进化对生物后续进化潜力的影响
- 数字进化实验验证: 基于Avida平台数据,复现或扩展协同进化相关实验
- 进化统计分析: 利用时间步数、任务数等数据,研究进化过程中的统计分布规律