数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)AX1743品系(npr-4(tm1782)X突变体)的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的行为特征,包含原始视频压缩文件、行为轨迹数据及特征提取结果,可用于研究npr-4基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 压缩文件
- 文件名称:npr-4 (tm1782)X on food R_2010_01_22__10_56_42__3.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为实验的原始视频相关数据,具体内容需解压后查看
- 行为轨迹数据文件
- 文件名称:npr-4 (tm1782)X on food R_2010_01_22__10_56_42__3.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为的轨迹数据,可能包含线虫骨架分段信息(共21753个分段骨架)、时间戳等基础行为记录
- 行为特征数据文件
- 文件名称:npr-4 (tm1782)X on food R_2010_01_22__10_56_42__3_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储经tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,实验总时长898.97秒,帧率26.9542帧/秒,视频像素对应实际长度4.48488微米/像素
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析npr-4(tm1782)X突变体与野生型线虫的行为差异,探究npr-4基因在行为调控中的作用
- 线虫行为特征分析: 基于提取的行为特征数据,研究线虫在食物环境中的运动模式、轨迹变化等行为规律
- 行为实验方法验证: 参考实验方案(Yemini等的方法),验证线虫行为实验的标准化流程及数据采集方法的可靠性
- 生物信息学模型训练: 利用行为轨迹和特征数据,训练线虫行为预测或分类的生物信息学模型