数据集概述
本数据集包含B-ALL白血病融合转录本NanoString nCounter多重检测技术的验证数据与分析结果,涉及融合转录本检测面板设计、RNA质量控制、检测下限验证、患者样本验证等内容,为该技术的临床应用提供数据支持。
文件详解
该数据集包含多个文件夹及文件,具体说明如下:
- 质量控制与评估文件(位于Quality Control and Assessment of the B-ALL Leukemia Fusion Detection NanoString Panel/目录下):
- 核心文件:
- Determination of RNA Quality Cut-Off of 150.png:PNG格式图片,展示RNA质量阈值确定结果
- Intrinsic Signal Noise Background Correction Probe-Specific.zip:压缩文件,包含探针特异性背景校正相关数据
- Lower Limit of Detection for B-ALL Leukemia NanoString Panel.zip:压缩文件,包含检测下限验证数据
- 基因表达分析子文件夹(Higher Expression Level of the 5 Cancer Gene Controls in Leukamia vs Normal Samples/):
- 5 Expression Level Controls in Leukemia vs Normal Samples Raw CSV Input File.csv:CSV格式,白血病与正常样本中5个癌症基因对照的原始表达数据,字段包括Sample(样本)、Gene(基因)、SampleType(样本类型)、CountNumber(计数)
- 5 Expression Level Controls in Leukemia vs Normal Samples More Detailed Raw CSV Input File.csv:CSV格式,更详细的原始表达数据
- Student t test for Leukemia vs WT samples.docx:Word文档,白血病与野生型样本的t检验结果
- 5 Expression Level Controls in Leukemia vs Normal Samples Boxplot Output Graph.PNG:PNG格式箱线图,展示基因表达分布
- 5 Expression Level Controls in Leukemia vs Normal Samples More Detailed Boxplot Output Graph.PNG:PNG格式详细箱线图
- 验证数据集文件(位于B-ALL Leukemia Fusion Detection NanoString Panel Validation Dataset/目录下):
- In-Vitro Transcribed RNAs.zip:压缩文件,体外转录RNA验证数据
- SickKids Brain Tumor and Sarcoma Negative Controls.zip:压缩文件,脑肿瘤与肉瘤阴性对照样本数据
- SickKids Peripheral Blood Bone Marrow Aspirate Patient Negative Samples.zip:压缩文件,外周血与骨髓穿刺患者阴性样本数据
- 患者阳性样本子文件夹(SickKids and COG Patient Positive Samples for Most Common and Ph-Like B-ALL Fusions/):
- Most Common B-ALL Fusions SickKids Positive Samples.zip:压缩文件,常见B-ALL融合的阳性样本数据
- Ph-Like B-ALL Fusions SickKids COG Positive Samples.zip:压缩文件,Ph样B-ALL融合的阳性样本数据
适用场景
- 白血病分子诊断研究:分析NanoString技术在B-ALL融合转录本检测中的应用价值
- 分子检测技术验证:评估多重数字检测技术的敏感性与特异性
- 临床检测面板开发:支持B-ALL融合转录本检测面板的优化与标准化
- 生物标志物研究:探索融合转录本作为B-ALL诊断与预后标志物的潜力