数据集概述
本数据集包含BAF60a调控β细胞身份与系统性葡萄糖稳态研究的多组学数据，涵盖ATAC-Seq、CUT&Tag-Seq、蛋白质组学、RNA-Seq及单细胞RNA-Seq数据，涉及对照组与敲除组小鼠胰岛样本，用于揭示BAF60a缺失对染色质构象、转录网络等的影响。
文件详解
该数据集按测序类型分为多个目录，具体文件说明如下：
- ATAC-Seq数据（位于ATAC/目录）：
- Pdx1CreCTR.normalized.bw：对照组样本标准化覆盖度文件，bw格式
- Pdx1CreKO.normalized.bw：敲除组样本标准化覆盖度文件，bw格式
- CUT&Tag-Seq数据（位于CUT&Tag-Seq/目录）：
- Chow_rep1_Coverage_noblacklist.bw：普通饮食组重复1无黑名单覆盖度文件，bw格式
- Chow_rep2_Coverage_noblacklist.bw：普通饮食组重复2无黑名单覆盖度文件，bw格式
- HFD_rep1_Coverage_noblacklist.bw：高脂饮食组重复1无黑名单覆盖度文件，bw格式
- HFD_rep2_Coverage_noblacklist.bw：高脂饮食组重复2无黑名单覆盖度文件，bw格式
- 蛋白质组学数据（位于Proteomics/目录）：
- Proteomics.xlsx：蛋白质组学数据文件，xlsx格式
- RNA-Seq数据（位于RNA-Seq/目录）：
- core_table.csv：核心数据表，包含基因ID、FPKM值、差异表达log2FC、q值等字段
- 单细胞RNA-Seq数据（位于ScRNA-Seq/目录）：
- CTR_dge.txt.gz：对照组差异基因表达数据压缩文件，gz格式
- BaBKO_dge.txt.gz：敲除组差异基因表达数据压缩文件，gz格式
适用场景
- 胰岛β细胞功能研究：分析BAF60a对β细胞身份维持的调控机制
- 代谢疾病机制研究：探究葡萄糖稳态失衡的分子通路
- 染色质调控研究：解析BAF60a在不同饮食条件下的染色质结合特征
- 多组学整合分析：整合转录组与蛋白质组数据研究β细胞功能网络
- 糖尿病治疗靶点研究：筛选BAF60a相关的潜在治疗靶点
