数据集概述
本数据集为基于系统发育方法的白垩纪陆生四足动物生物地理网络分析结果，包含方法验证（如出生-死亡模型模拟）、五类四足动物（陆生鳄形类、陆生龟类、非鸟类恐龙、鸟类、翼龙）的生物地理网络构建数据，以及相关分析代码与可视化图表，共12个文件。
文件详解
- 可视化图表文件（.gif，8个）
- 文件名称示例：var ALW bdtree .gif、mean EI bdtree .gif、mean ratio of unusable nodes.gif
- 文件格式：GIF
- 内容说明：包含出生-死亡模型模拟的网络指标（如平均特有性指数EI、平均连接密度LD、平均连接权重ALW）及其变异值，以及不可用节点比例的可视化结果
- 模拟结果文件（.csv，1个）
- 文件名称：bdtree results.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射：包含出生-死亡模型参数（q）、分类单元数、区域数、平均特有性指数、特有性指数变异值、平均不可用节点数、连接密度均值及变异值、连接权重均值及变异值等字段
- 压缩包文件（.rar，1个）
- 文件名称：data and tree.rar
- 文件格式：RAR
- 内容说明：包含原始数据与系统发育树文件
- 分析代码文件（.txt，1个）
- 文件名称：rcode0801.txt
- 文件格式：TXT
- 内容说明：包含将系统发育树转换为生物地理网络的R语言代码（treetonetwork函数），涉及geiger、phangorn等包的调用
- 模拟结果文件（.xlsx，1个）
- 文件名称：results of taxa dropping simulations.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 内容说明：包含分类单元删减模拟的结果数据
数据来源
论文“Biogeographical network analysis of cretaceous terrestrial tetrapods: a phylogeny-based approach”
适用场景
- 生物地理网络方法验证: 基于出生-死亡模型模拟结果，评估系统发育驱动的生物地理网络构建方法的有效性
- 白垩纪四足动物生物地理研究: 分析陆生鳄形类、恐龙、鸟类、翼龙等类群的生物地理网络拓扑结构与区域划分
- 生物地理网络指标评估: 验证特有性指数、连接密度、连接权重等指标在古生物地理研究中的适用性
- 古生物地理信号提取: 从系统发育数据中提取白垩纪大陆板块（如冈瓦纳、劳亚古陆）的生物地理关联信号
- 系统发育与生物地理整合分析: 利用R代码复现“系统发育树→生物地理网络”的转换过程，开展相关方法拓展研究
