数据集概述
本数据集记录白足鼠（Peromyscus leucopus）成纤维细胞经脂多糖（LPS）或缓冲液处理后的差异表达基因（DEG）。实验识别出543个受LPS调控的基因，包含上调、下调基因的倍数变化及假发现率（FDR）p值，还列出对照组中TPM最高的10个蛋白编码基因，是研究白足鼠免疫应答分子机制的基础数据。
文件详解
- README.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含数据集标题、作者信息（负责人Alan Barbour，加州大学欧文分校）、生成时间（2021-03-02）等基础信息，用于说明数据集背景与来源。
- Table_fibroblastDEGs.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录差异表达基因信息，包含基因名称、LPS处理组相对于对照组的倍数变化、FDR p值，可区分上调（如Nfkb亚基、Saa）和下调基因。
适用场景
- 分子免疫学研究：分析白足鼠成纤维细胞对LPS的基因表达应答，探究天然免疫信号通路（如NF-κB）的激活机制。
- 基因表达调控分析：通过差异基因的倍数变化和FDR值，筛选LPS处理下关键的功能基因（如Nos2、Sod2）。
- 比较免疫学研究：结合家鼠（Mus musculus）的相关数据，对比两种鼠类对LPS应答的分子差异。
- 生物标志物筛选：识别成纤维细胞中对LPS刺激敏感的基因，为炎症相关疾病的生物标志物研究提供参考。
