半水生蝽COX1突变驱动结构创新与沉默tRNA变异研究补充数据集

数据集概述

该数据集是关于半水生蝽(Gerromorpha)的研究补充数据,包含基于不同数据集和分析方法构建的系统发育树、线粒体基因转录模型、选择压力分析、分歧时间树及COX1密码子序列比对等内容,支持COX1突变驱动结构创新的研究结论。

文件详解

  • 系统发育树文件(PDF格式,共14个):
  • 如Supplement Fig 1 fp.mitoGV_AA.pdf:基于AA数据集最大似然法(全分区)构建的Gerromorpha系统发育树,带自举支持值,标*为研究测序物种
  • 如Supplement Fig 10 PhyloBayes_P123R.pdf:基于P123R数据集的贝叶斯系统发育树,带后验概率支持值
  • 如Supplement Fig 14 Time_tree.pdf:Gerromorpha分歧时间树,含95%可信区间及化石校准点
  • 序列比对文件:
  • Supplement Fig 15 COX1 codon alignment.html:HTML格式,Gerromorpha线粒体COX1密码子多序列比对可视化结果
  • 转录组存档文件:
  • Potamometra zhengi full-length transcript archive.zip:ZIP格式,含Potamometra zhengi全长转录本存档及可导入Geneious的GFF文件

适用场景

  • 昆虫分子系统学研究:分析Gerromorpha类群的系统发育关系与分歧时间
  • 线粒体基因进化研究:探究COX1突变对结构创新的驱动作用及沉默tRNA变异的影响
  • 转录组学分析:可视化Potamometra zhengi线粒体基因的转录模型
  • 选择压力分析:研究Gerromorpha线粒体蛋白编码基因的选择压力与密码子适应性(CAI)特征
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 1.9 MiB
最后更新 2025年12月7日
创建于 2025年12月7日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。