数据集概述
本数据集基于Illumina Bovine SNP50芯片的高密度基因组标记,分析布基纳法索Baoulé与Zebu杂交牛的个体 admixture比例及局部祖先偏差,以识别锥虫感染相关的选择信号。通过直接ELISA检测牛只锥虫感染状态,计算29条常染色体SNP的局部祖先偏离平均值,筛选FST异常位点,确定祖先信息SNP集合,为牛群遗传保护与改良提供基础。
文件详解
- 文件名称:data_SNPs.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包包含基于Illumina Bovine SNP50 BeadChip的杂交牛基因组SNP数据,涉及个体 admixture比例、29条常染色体SNP局部祖先偏差值、锥虫感染阳性/阴性个体的染色体选择信号区域(如阳性个体8号、19号染色体,阴性个体6、19、21、22号染色体)、7个FST异常变异位点及祖先信息SNP集合等数据内容。
适用场景
- 动物遗传学研究: 分析杂交牛基因组中锥虫感染抗性相关的选择信号区域及遗传标记。
- 牛群遗传改良: 基于祖先信息SNP开发常规 admixture检测工具,优化杂交牛锥虫耐受性选育方案。
- 本土牛种保护: 为布基纳法索Baoulé牛的遗传完整性保护提供数据支持。
- 兽医流行病学应用: 探究牛锥虫病抗性的分子机制,指导社区层面的牛群健康管理策略。