Barclay_Powell_形态学遗传分析论文补充数据

数据集概述

本数据集为Barclay Powell博士论文第二章所使用的形态学补充数据,主要用于遗传学分析。数据包含全基因组关联分析(GWAS)相关的基因型文件和主成分分析(PCA)结果,涵盖单核苷酸多态性(SNP)数据、主成分载荷文件以及分析结果可视化图表。数据集共包含六个文件,涉及五种不同的文件格式。

文件详解

  • 基因型数据文件(PLINK格式)
  • 文件名称: CleanMeasuresSNPsJune2025.famCleanMeasuresSNPsJune2025.bedCleanMeasuresSNPsJune2025.bim
  • 文件格式: FAM、BED、BIM
  • 字段映射介绍: 此为标准的PLINK二进制格式基因型数据,其中FAM文件包含样本家族信息,BED文件存储基因型矩阵,BIM文件记录SNP标记信息(如染色体、位置、等位基因)。
  • 主成分分析载荷文件
  • 文件名称: PC1Chr7markers.txt.ldPC1Chr1markers.txt.ld
  • 文件格式: LD (文本格式)
  • 字段映射介绍: 可能包含染色体1和7上SNP标记与第一主成分(PC1)的连锁不平衡(LD)或载荷系数信息。
  • 可视化图表文件
  • 文件名称: Figure Scree plot PC analysis Body measures.png
  • 文件格式: PNG
  • 字段映射介绍: 为主成分分析的碎石图(Scree Plot)可视化结果,用于展示各主成分解释的方差比例。

数据来源

Barclay Powell博士论文

适用场景

  • 遗传学与形态学关联研究: 利用GWAS数据探索形态学性状(如身体测量指标)与遗传标记(SNP)之间的关联性。
  • 群体遗传结构分析: 通过主成分分析(PCA)研究样本群体的遗传结构或分层情况。
  • 生物信息学方法验证: 作为PLINK等标准遗传分析工具链的输入数据,用于方法学验证或教学示例。
  • 学术研究与可重复性: 为相关领域研究者提供论文结果的原始数据支持,促进科学研究的可重复性与深入分析。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 5.75 MiB
最后更新 2025年11月28日
创建于 2025年11月28日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。