数据集概述
本数据集基于埃及西部沙漠热干旱环境中的本土Barki山羊和绵羊的50K SNP芯片基因型数据,分析其基因组选择信号,识别出119个候选基因,涉及热耐受、体型发育、能量代谢等适应相关性状,还发现两物种共享的8个候选基因及保守同线性区段,为畜牧适应机制研究提供基础。
文件详解
- 文件名称:
plinkBarkiRuminants.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包包含基于caprine和ovine 50K SNP BeadChips生成的基因型数据,可用于分析与热干旱环境适应相关的选择信号区域及候选基因(如FGF2、BMP2、MYH家族基因等)
数据来源
论文“Multiple genomic signatures of selection in goats and sheep indigenous to a hot arid environment”
适用场景
- 畜牧基因组选择信号分析:研究Barki山羊和绵羊在热干旱环境下的自然选择机制及候选基因功能
- 适应性性状遗传基础研究:分析热耐受、体型发育、能量代谢等适应性状的分子遗传基础
- 跨物种选择信号比较:探索山羊与绵羊在相同极端环境下的共享选择模式及保守基因组区段
- indigenous livestock遗传资源评估:为本土畜牧品种的适应性评估及遗传资源保护提供数据支持