BaumsEtAl_14_DRYAD_Based_加勒比鹿角珊瑚与共生甲藻基因型种群遗传学研究数据

数据集概述

本数据集包含加勒比鹿角珊瑚(Acropora palmata)及其共生甲藻(Symbiodinium 'fitti')的基因型数据,通过13个单倍体微卫星位点解析宿主与共生体的个体基因型,覆盖物种全分布范围,揭示宿主-共生体种群遗传结构差异及基因流特征,为珊瑚礁生态系统适应环境胁迫的潜力研究提供基础数据。

文件详解

  • README文档
  • 文件名称:README_for_BaumsEtAl_14_DRYAD_Sfitti_genotypes.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:说明数据集背景,包含Symbiodinium 'fitti'的13个单倍体微卫星位点多位点基因型数据,提及微卫星基因分型的可靠性及影响因素。
  • 基因型数据文件
  • 文件名称:BaumsEtAl_14_DRYAD_Sfitti_genotypes.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:存储共生甲藻Symbiodinium 'fitti'的基因型核心数据。
  • Structure分析文件
  • 文件名称:BaumsEtAl_14_DRYAD_Structure_mainparams、BaumsEtAl_14_DRYAD_StructureInputFile
  • 文件格式:无扩展名
  • 字段映射介绍:包含Structure软件分析的主参数配置文件及输入文件,用于种群遗传结构分析。
  • 网络分析文件
  • 文件名称:BaumsEtAl_14_DRYAD_NetworkOutfile.out、BaumsEtAl_14_Network_InputFile.ych
  • 文件格式:OUT、YCH
  • 字段映射介绍:网络分析的输入文件与输出结果,用于解析基因型间的网络关系。

数据来源

论文“New insights into the dynamics between reef corals and their associated dinoflagellate endosymbionts from population genetic studies”(DRYAD数据库)

适用场景

  • 珊瑚-共生体种群遗传结构研究: 分析宿主珊瑚与共生甲藻的基因型分布及种群分化特征。
  • 宿主-共生体基因流比较: 基于基因流数据揭示宿主与共生体种群遗传结构差异的形成机制。
  • 珊瑚礁适应环境胁迫潜力评估: 探究基因型互作对珊瑚礁生态系统适应环境变化的影响。
  • 微卫星基因分型方法验证: 参考文档中微卫星基因分型的可靠性及影响因素分析,优化相关实验设计。
  • 共生体有性繁殖研究: 基于重组基因型数据验证共生甲藻在宿主体内的有性重组现象。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.17 MiB
最后更新 2026年1月6日
创建于 2026年1月6日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。